Живут суслики колониями, в качестве дома выкапывая себе относительно простые, хотя и длинные норы на глубину до 2-3 метров, протяжённостью от 3 до 8 метров. Зверек выкапывает наклонный вход, затем на горизонтальном участке располагается гнездовая камера, несколько тупиковых отнорков. Второй вертикальный вход в нору он копает уже изнутри норы.

Каждый год зверьки перестраивают свои норы или роют новые по соседству. Кроме основных нор суслики роют временные небольшие норки, которые используют как укрытия. Во время кормления зверьки не отходят от нор дальше, чем на полтора метра.

Часто, встав столбиком около норы, зверки осматривают окрестности и, заметив опасность, издают резкий свист. Услышав такой свист или увидев бегущего соседа, вся колония бросается к своим норам.

Питаются суслики сочными травами, луковицами, иногда насекомыми, делая небольшие запасы в 200 – 500 граммов для того, чтобы переждать летнюю непогоду. На зиму зверьки впадают в спячку, предварительно выкопав вентиляционный канал над гнездовой камерой, который немного не доходит до поверхности, он и послужит весной в качестве выхода, а вход в нору забивают земляной пробкой.

Спячка длится от 6 месяцев, но некоторые самцы, выполнив свои обязательства перед родом и набрав необходимый жирок для спячки, могут залегать в неё уже в июле. Молодежь и самки уходят на зимний сон в августе, сентябре.

Просыпаются зверьки, когда начинает сходить снег, и через полторы-две недели наступает период размножения. В это время самцы становятся агрессивны, «боксируя» с соперниками прогоняют их от норок своих избранниц. Через 3-4 недели появляется молодежь, численность которых может доходить до девяти особей в выводке, но около 70% погибнет уже в первый год от хищников или неудачной зимовки. Живут в природе суслики около четырех лет.

Ещё не так давно, в середине прошлого века, с ними боролись, как с вредителями сельхозкультур, и заготавливали в среднем до 1,5 миллионов шкурок в год. Сейчас, по мнению специалистов, численность крапчатого суслика в России составляет от 6 до 15 тысяч особей, вид занесен в Красную книгу Российской Федерации.